Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tff1Q08423 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tff1Q08423 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tff1Q08423 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tff1Q08423 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tff1Q08423 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tff1Q08423 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tff1Q08423 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tff1Q08423 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tff1Q08423 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tff1Q08423 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tff1Q08423 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tff1Q08423 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Tff1Q08423 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tff1Q08423 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms