Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm3Q08189 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms