Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf1Q07802 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms