Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
AmbpQ07456 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AmbpQ07456 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AmbpQ07456 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
AmbpQ07456 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
AmbpQ07456 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AmbpQ07456 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AmbpQ07456 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
AmbpQ07456 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AmbpQ07456 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AmbpQ07456 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AmbpQ07456 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AmbpQ07456 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AmbpQ07456 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AmbpQ07456 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
AmbpQ07456 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AmbpQ07456 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms