Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms