Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprgQ05909 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprgQ05909 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms