Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk18Q04899 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk18Q04899 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms