Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms