Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox12Q04890 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms