Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox8Q04886 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms