Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms