Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx2Q03358 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms