Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1sQ02789 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms