Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a2Q02788 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms