Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms