Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VcpQ01853 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms