Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1cQ01815 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms