Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HmgcrQ01237 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms