Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col1a2Q01149 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col1a2Q01149 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col1a2Q01149 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col1a2Q01149 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col1a2Q01149 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms