Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Grin2bQ01097 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms