Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms