Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8a1Q00558 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms