Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pax8Q00288 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax8Q00288 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax8Q00288 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax8Q00288 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax8Q00288 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax8Q00288 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax8Q00288 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax8Q00288 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax8Q00288 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax8Q00288 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax8Q00288 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax8Q00288 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms