Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bmp1P98063 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bmp1P98063 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms