Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfcP97953 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VegfcP97953 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms