Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlkP97793 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlkP97793 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlkP97793 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlkP97793 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlkP97793 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlkP97793 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlkP97793 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlkP97793 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlkP97793 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlkP97793 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlkP97793 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlkP97793 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlkP97793 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlkP97793 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlkP97793 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlkP97793 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlkP97793 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AlkP97793 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlkP97793 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlkP97793 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlkP97793 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlkP97793 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlkP97793 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlkP97793 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlkP97793 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlkP97793 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlkP97793 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlkP97793 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlkP97793 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AlkP97793 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlkP97793 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlkP97793 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlkP97793 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlkP97793 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlkP97793 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlkP97793 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlkP97793 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AlkP97793 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AlkP97793 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AlkP97793 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AlkP97793 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms