Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited1P97769 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms