Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2cP97760 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms