Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cmklr1P97468 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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