Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas2P97460 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas2P97460 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms