Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Nbr1P97432 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nbr1P97432 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Nbr1P97432 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Nbr1P97432 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Nbr1P97432 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Nbr1P97432 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Nbr1P97432 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Nbr1P97432 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Nbr1P97432 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Nbr1P97432 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Nbr1P97432 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Nbr1P97432 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Nbr1P97432 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Nbr1P97432 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nbr1P97432 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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