Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3aP97351 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3aP97351 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3aP97351 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3aP97351 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms