Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp1P97350 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms