Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms