Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfbiP82198 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfbiP82198 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms