Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Otx2P80206 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Otx2P80206 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Otx2P80206 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Otx2P80206 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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