Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms