Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Msx3P70354 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx3P70354 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx3P70354 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx3P70354 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms