Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sycp3P70281 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms