Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Rad54lP70270 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms