Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SbdsP70122 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms