Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb4bP68372 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms