Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps17P63276 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms