Protein–RNA interactions for Protein: P62932

Fbxo40, F-box only protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo40P62932 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms