Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hpcal1P62748 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hpcal1P62748 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms