Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps13P62301 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms