Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lmo4P61969 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lmo4P61969 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms