Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme3P61290 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psme3P61290 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psme3P61290 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms