Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ActbP60710 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ActbP60710 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ActbP60710 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ActbP60710 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms