Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eif3eP60229 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms